泥鳅肠道短小，对动物性饵料消化速度比植物性饵料快。如泥鳅消化浮游生物仅需4小时，消化蛆叫、蝇蛆等只需4.5小时，而消化浮萍、水葫芦须根则需要7小时。泥鳅贪食，投喂过多的动物性饵料时，会因贪食过量而影响肠呼吸，并产生毒害气体而致死。实际上泥鳅的食欲与水温的变化节律高度息息相关，水温24—27℃时，食欲最旺盛，摄食量最大，生长速度快；水温低于15℃或超过29℃时，食欲剧减，生长缓慢。在泥鳅生殖时期食量比较大，雌鳅比雄鳅更大，以满足生殖时期卵黄积累和生殖活动的需要。由于泥鳅不适应高温和强光，故摄食时间一般在7：00—8：00和18：0020：00。