鳅卵的孵化，如属粗放自然产卵形式，可在产卵池中让其自然孵化。由于受精卵粘性不强，为提高孵化率，可在产卵结束后将鱼巢小心捞起，移置于育苗池或孵化缸中孵化。

育苗池中孵化，一般选面积40平方米左右的长方形池为宜，在鱼池四周筑一道高约30厘米的防水墙，防止雨水流人池中。育苗池先按常规进行消毒，培肥水。每池可吊挂50万粒受精卵，一般可孵出20万尾鱼一苗。

孵化缸孵化，密度一般每升水放500、600粒受精卵，水的流速掌握在刚好搅动受精卵即可。待出膜时，稍加大流速，直至鱼苗平游，再逐步减少流量。要避免过度消耗鱼苗的体力。

孵化时间与水温有密切关系。最适水温为25℃。